作为中国电子口岸的配套服务项目，中国电子口岸网上支付系统与中国电子口岸其他业务系统以及银行内部已有的业务系统相连接，改变传统的税费支付方式，为用户提供准确、方便、快捷的网上金融服务。

　　采用网上支付的客户，通过中国电子口岸查询到应付税费款额后，可在 网上发布支付指令，银行接到支付指令后，可直接从用户在银行开设的预储帐号中划转税费，划转成功后，用户可直接办理相关手续。网上支付业务的推出将缩短通关时间，提高通关效率，减低贸易成本。中国电子口岸网上支付系统中国银行子系统是由海关和中国银行合作开发。